Jmol是一个用Java语言编写的免费的、开源的、跨平台的新一代分子可视化软件,用来显示各种三维化学信息。对科学研究有一定的帮助,请需要的朋友前来下载使用!!!
什么是可视化?
种类繁多的信息源产生的大量数据,远远超出了人脑分析解释这些数据的能力。由于缺乏大量数据的有效分析手段,大约有95%的计算被浪费,这严重阻碍了科学研究的进展。为此,美国计算机成像专业委员会提出了解决方法——可视化。可视化技术作为解释大量数据最有效的手段而率先被科学与工程计算领域采用,并发展为当前热门的研究领域——科学可视化。
可视化把数据转换成图形,给予人们深刻与意想不到的洞察力,在很多领域使科学家的研究方式发生了根本变化。可视化技术的应用大至高速飞行模拟,小至分子结构的演示,无处不在。在互联网时代,可视化与网络技术结合使远程可视化服务成为现实,可视区域网络因此应运而生。它是SGI公司在2002年3月提出的新理念。它的核心技术是可视化服务器硬件和软件。
科学可视化的主要过程是建模和渲染。建模是把数据映射成物体的几何图元。渲染是把几何图元描绘成图形或图像。渲染是绘制真实感图形的主要技术。严格地说,渲染就是根据基于光学原理的光照模型计算物体可见面投影到观察者眼中的光亮度大小和色彩的组成,并把它转换成适合图形显示设备的颜色值,从而确定投影画面上每一像素的颜色和光照效果,最终生成具有真实感的图形。真实感图形是通过物体表面的颜色和明暗色调来表现的,它和物体表面的材料性质、表面向视线方向辐射的光能有关,计算复杂,计算量很大。因此工业界投入很多力量来开发渲染技术。
分子可视化软件(Jmol)功能
Jmol拥有简洁直观的布局,让用户可能上传文件的格式:ADF,MDL,PDB,CIF,或XYZ。
该应用程序允许用户放大或缩小、移动和旋转所选对象以不同的角度,选取一组原子,测量原子间的距离,使动画模式,创建一个列表和原子和修改方面的FPS,其性质规模、幅度、半径、振动,以及撤销或重做操作。
有几个配置设置,旨在帮助您选择一个默认的原子大小,指定键合的距离,键半径和公差,使用内置的脚本编辑器,以及检查错误和历史细节的控制台。所产生的信息可以打印,复制到剪贴板,或导出为JPG,PNG,或ppm。所有的事情考虑,Jmol是挤满了有限的功能,帮助您在3D环境中的化学数据分析。虽然它不能被视为最顶级的产品从它的类别,该工具做什么,它说,是适合初学者和专业人士。
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分子可视化软件(Jmol)使用
在一个三维的工作环境中查看和分析化学信息,以及打印,复制到剪贴板,或将数据导出到JPG,PNG,或ppm
Jmol是一个Windows实用工具专门为帮助您分析3D工作环境化学信息建立。这是一个基于java的应用程序,所以在安装应用程序之前,你应该确保你的计算机上安装的环境。
因为这是一个可移植的程序,重要的是,它不会在窗口注册表中留下任何痕迹。你可以复制任何USB闪存驱动器或其他设备,并把它与你当你需要研究在微风中化学信息。
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